背景[1-6]
MagMAX-96 DNA Multi-Sample Kit設計用于從各種樣品類型中快速純化高質量的基因組DNA，包括血液和血卡，組織，小鼠尾巴，口腔拭子，血沉棕黃層和培養(yǎng)細胞。這些純化試劑盒使用基于MagMAX™磁珠的核酸分離技術生產高產量的純化DNA，不含可能影響下游反應的抑制劑，如基因分型檢測，CE和新一代測序，以及高分辨率熔解分析。96-prep和5x 96-prep試劑盒專為更高通量和自動化格式處理而設計。
隨著新的分析方法和技術的發(fā)展，例如高通量基因分型和下一代DNA測序平臺，對DNA產量和純度的要求變得更加嚴格。MagMAX™DNA多樣品試劑盒通過提供不含核酸酶，蛋白質和其他下游酶促反應抑制劑的高純度DNA來應對挑戰(zhàn)。使用MagMAX TM DNA多樣品試劑盒可以從多種材料中獲得具有高產率和純度的DNA。這與基于濾膜的方法形成對比，所述方法通常需要針對各種輸入材料的不同套件配置。對于需要產量，小批量或DNA存檔目的的應用，可能需要MagMAX™DNA多樣品試劑盒（管形式，手動處理），因為可以容納更大的樣品輸入。使用MagMAX™-96 DNA多樣品試劑盒（96孔板格式，與自動化處理兼容）可獲得適合大多數(shù)常規(guī)應用的DNA產量。
MagMAX™DNA多樣品試劑盒還可分別從脂質或富含糖原的樣品（如腦和肝組織）中提供高產量的DNA。顯示使用MagMAX™DNA多樣品試劑盒從組織中純化的DNA比使用基于濾膜的方法得率多兩倍。
大多數(shù)酶分子應用易于被樣品基質（例如，血紅素，肝素，鹽，蛋白質）或純化方法本身（苯酚，鹽，醇）攜帶的分析物抑制。說明了DNA純度對敏感分子應用的影響，例如定量PCR（qPCR）。使用MagMAX™-96 DNA多樣品試劑盒或競爭對手的基于濾膜的試劑盒從血液中提取DNA，并進行實時PCR分析。使用MagMAX™DNA多樣品試劑盒純化的DNA獲得的循環(huán)閾值CT值低于使用濾膜試劑盒純化的DNA獲得的值，表明MagMAX™試劑盒產生更高純度的DNA。
應用[7][8]
MagMAX-96 DNA Multi-Sample Kit可用于桉樹DNA自動提取及木素相關QTL定位：
人工林為工業(yè)生產提供高質量的木質生物素原料,同時也作為重要的固碳庫。近年來,隨著楊樹、桉樹等樹種全基因組測序的完成和高通量測序技術的發(fā)展,樹木的分子生物學研究進入了高通量的基因組研究階段,并取得了一些成果。對于樣品量大的林木群體基因組學和全基因組關聯(lián)研究等,自動化、高通量的實驗操作尤為必要。
(1)樹木葉片DNA自動提取方法的優(yōu)化和建立。以桉樹4種/雜種的葉片為材料,比較了5種磁珠試劑盒在KingFisher Flex核酸純化系統(tǒng)上自動提取的DNA得率和純度,初步選出了2種較好的試劑盒。比較了KingFisher Flex上不同的洗滌速度,為Medium。
(2)DNA自動提取方法在桉樹雜交子代的父本分析中的應用。參試材料為包含1株母本、2株待確定父本和93株子代的桉樹群體,參試標記為具多態(tài)性的16個EST-SSR標記。在95%的置信水平下,成功鑒定出92株子代的父本。其中,87株子代的父本為目的父本,5株子代的父本為外源花粉污染。由此,證明了本研究所構建的DNA自動提取方法能成功應用于桉樹基于EST-SSR標記的基因分型實驗中,為該方法進一步推廣應用到其他林木樹種的分子生物學研究中奠定基礎。(3)桉樹木素含量和G/S相關QTL定位。
參考文獻
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