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棕蜱通用PCR試劑盒的應用

2024/2/4 9:36:39 作者:云霄

背景[1-3]

棕蜱通用PCR試劑盒是一種用于檢測棕蜱的PCR試劑盒。棕蜱是一種常見的寄生蟲,可以傳播多種疾病,如萊姆病、斑疹傷寒等。該試劑盒包含以下主要成分:

PCR反應液:包含聚合酶、dNTPs、引物等,用于擴增棕蜱的DNA。

陽性對照:含有已知的棕蜱DNA,用于驗證試劑盒的準確性和可靠性。

陰性對照:不含棕蜱DNA,用于排除假陽性結果。

樣品處理液:用于提取和處理樣品中的DNA。

緩沖液:用于調節(jié)PCR反應液的pH值和離子強度。

其他輔助試劑:如Tris-HCl、EDTA、BSA等,用于調節(jié)反應條件和提高反應效率。

使用棕蜱通用PCR試劑盒時,首先需要提取樣品中的DNA,然后將其加入到PCR反應液中進行擴增。通過檢測擴增產物的特異性,可以確定樣品中是否存在棕蜱的DNA。該試劑盒具有靈敏度高、特異性強、操作簡便等優(yōu)點,適用于臨床實驗室和研究機構對棕蜱的快速檢測和鑒定。

棕蜱通用PCR試劑盒.png

棕蜱通用PCR試劑盒

棕蜱通用PCR試劑盒的操作步驟如下:

1.樣本采集:從患者體內采集血液、糞便、組織等樣本,并將其保存在無菌容器中。

2.DNA提?。簩⒉杉降臉颖具M行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取試劑盒。提取后的DNA應保存在-20°C或更低的溫度下。

3.PCR反應體系準備:根據(jù)棕蜱通用PCR試劑盒說明書的要求,配制PCR反應體系,包括引物、熒光探針、dNTPs、DNA聚合酶等。

4.PCR反應:將提取的DNA加入到PCR反應體系中,進行PCR反應。反應條件和時間根據(jù)試劑盒說明書的要求進行設置。

5.結果分析:將PCR反應后的產物進行熒光信號檢測,根據(jù)熒光信號的出現(xiàn)情況判斷是否存在棕蜱的感染。

應用[4][5]

棕蜱通用PCR試劑盒可以用于森林革蜱和草原革蜱PCR-RFLP鑒別方法的建立及線粒體基因組序列分析

是建立一種森林革蜱和草原革蜱的分子鑒定方法,即以核糖體內轉錄間隔區(qū)2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列為基礎建立森林革蜱和草原革蜱的PCR-RFLP方法。通過提取森林革蜱和草原革蜱的基因組DNA,設計引物,棕蜱通用PCR試劑盒PCR擴增和測序,最終獲得準確的森林革蜱和草原革蜱的ITS2序列,并運用DNAStar軟件對所得序列的限制性片段長度多態(tài)性進行分析。研究發(fā)現(xiàn),森林革蜱和草原革蜱ITS2的PCR擴增產物經限制性內切酶Spe I酶切后所得片段明顯不同,森林革蜱ITS2 PCR產物不能被切開而草原革蜱則被切成兩段??梢?運用PCR-RFLP方法可成功鑒別森林革蜱和草原革蜱。目前關于革蜱的研究主要局限于形態(tài)學、流行病學、綜合防治及蜱傳疾病等方面,而關于線粒體基因組方面的研究很少。

擴增森林革蜱線粒體的全基因組序列并對其結構特點進行分析,探討革蜱屬的進化分類關系。棕蜱通用PCR試劑盒結果顯示,森林革蜱線粒體基因組全長為14945 bp,由13個蛋白質編碼基因、2個非編碼區(qū)、22個t RNA和2個核糖體RNA構成,各基因排列順序與后溝類硬蜱相似。森林革蜱整個線粒體基因組核苷酸組成為A=38.89%,T=39.89%,G=8.94%,C=12.29%,A+T含量為78.78%。在森林革蜱的線粒體基因組t RNA-Glu和nad1之間存在一個插入基因,長度為127bp,含有3個重復序列“similar to nad1”。運用BI、ML和MP三種方法分別以森林革蜱線粒體基因組的13個蛋白質編碼基因為標記構建系統(tǒng)進化樹,結果發(fā)現(xiàn)三種建樹方法所得結果一致或相似,即進化樹分為兩大分支,后溝類硬蜱和前溝類硬蜱各形成一個分支,森林革蜱位于后溝類硬蜱分支上。在后溝類這一分支中,革蜱屬、扇頭蜱屬和凹溝蜱屬均形成單一分支,而花蜱屬和血蜱屬形成復分支。革蜱屬與扇頭蜱屬親緣關系較其它蜱屬近。

參考文獻

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[5]郭東輝.森林革蜱和草原革蜱PCR-RFLP鑒別方法的建立及線粒體基因組序列分析[D].黑龍江八一農墾大學,2016.

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