背景[1-3]
乳突類圓線蟲PCR試劑盒是一種專門用于檢測和診斷乳突類圓線蟲感染的分子生物學(xué)工具。乳突類圓線蟲是一類寄生于人類和動物消化道中的線蟲,其中一些種類如蛔蟲(Ascaris lumbricoides)和鉤蟲(Ancylostoma duodenale)等能夠引起嚴(yán)重的健康問題。
PCR(聚合酶鏈反應(yīng))技術(shù)通過擴(kuò)增特定的DNA片段來檢測病原體的存在。乳突類圓線蟲PCR試劑盒通常包含所有必要的組分來執(zhí)行PCR反應(yīng),包括:
PCR緩沖液:提供適合DNA聚合酶活性的pH和離子條件。
dNTP混合物:含有脫氧核苷酸(dATP、dCTP、dGTP、dTTP),作為合成新DNA鏈的原料。
引物:一對短的單鏈DNA片段,與乳突類圓線蟲的特定DNA序列互補(bǔ),引導(dǎo)DNA合成。
DNA聚合酶(通常是Taq聚合酶):催化DNA鏈的復(fù)制過程。
模板DNA:從患者樣本中提取的可能含有乳突類圓線蟲DNA的樣本。
陽性和陰性對照:分別用于確認(rèn)PCR反應(yīng)有效性和排除污染的可能性。
其他添加劑:如MgCl2等,為DNA聚合酶的活性提供必需的輔助因子。
使用該試劑盒時,首先需要從疑似感染者的樣本(如糞便)中提取DNA,然后將提取出的DNA作為模板加入到預(yù)先配制好的PCR反應(yīng)體系中。接下來,將反應(yīng)管放入PCR儀器中,按照特定的溫度和時間周期進(jìn)行熱循環(huán),以擴(kuò)增目標(biāo)DNA序列。最后,通過瓊脂糖凝膠電泳或其他檢測方法來分析PCR產(chǎn)物,從而確定樣本中是否存在乳突類圓線蟲的DNA。
乳突類圓線蟲PCR試劑盒
乳突類圓線蟲PCR試劑盒的操作步驟如下:
1.樣本采集:從患者體內(nèi)采集血液、糞便、組織等樣本,并將其保存在無菌容器中。
2.DNA提取:將采集到的樣本進(jìn)行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取試劑盒。提取后的DNA應(yīng)保存在-20°C或更低的溫度下。
3.PCR反應(yīng)體系準(zhǔn)備:根據(jù)乳突類圓線蟲PCR試劑盒說明書的要求,配制PCR反應(yīng)體系,包括引物、熒光探針、dNTPs、DNA聚合酶等。
4.PCR反應(yīng):將提取的DNA加入到PCR反應(yīng)體系中,進(jìn)行PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件和時間根據(jù)試劑盒說明書的要求進(jìn)行設(shè)置。
5.結(jié)果分析:將PCR反應(yīng)后的產(chǎn)物進(jìn)行熒光信號檢測,根據(jù)熒光信號的出現(xiàn)情況判斷是否存在乳突類圓線PCR試劑盒的感染。
應(yīng)用[4][5]
乳突類圓線蟲PCR試劑盒可以用于七個地區(qū)圈養(yǎng)林麝腸道寄生蟲感染情況調(diào)查及分子生物學(xué)鑒定
利用分子寄生蟲學(xué)方法對7個地區(qū)圈養(yǎng)林麝艾美耳球蟲、類圓線蟲陽性糞便樣品的蟲卵或卵囊進(jìn)行蟲種鑒定。通過提取7個地區(qū)圈養(yǎng)林麝蟲卵或卵囊的DNA,采用乳突類圓線蟲PCR試劑盒優(yōu)化的巢氏PCR或常規(guī)PCR技術(shù)分別擴(kuò)增艾美耳球蟲和類圓線蟲18S r RNA基因片段進(jìn)行分子鑒定,并對所得蟲種序列進(jìn)行序列和種群遺傳進(jìn)化分析。
乳突類圓線蟲PCR試劑盒結(jié)果顯示:(1)艾美耳球蟲18S r RNA基因運用巢氏PCR擴(kuò)增出的片段大小均為797~822 bp,34種類型18S r RNA基因序列相似性為90.5%~100%,茂縣(MX1-7)的相似性為96.8%~99.0%、都江堰市(DJY1-5)的相似性為95.0%~96.8%、馬爾康市(MEK1-8)的相似性為96.1%~99.5%、理縣(LX1-3)的相似性為95.2%~97.0%、瀘定縣(LD1-2)的相似性為92.6%、漢源縣(HY1-3)的相似性為95.1%~100%、陜西渭南市(SX1-6)的相似性為98.8%~99.0%;基于艾美耳球蟲18S r RNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果表明寄生于圈養(yǎng)林麝內(nèi)的球蟲鑒定為艾美耳球蟲。
(2)類圓線蟲18S r RNA基因運用乳突類圓線蟲PCR試劑盒常規(guī)PCR擴(kuò)增出的片段大小均為360 bp,6份圈養(yǎng)林麝糞便樣品中類圓線蟲18S r RNA基因序列完全一致,經(jīng)序列分析比對與多株不同地域和宿主動物源的乳突類圓線蟲18S r RNA基因序列相似性為95.4%~99.0%;基于18S r RNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出本研究得到的類圓線蟲18S r RNA基因序列與NCBI上公布的乳突類圓線蟲聚類在同一支上;因此,6份圈養(yǎng)林麝類圓線蟲蟲卵樣品鑒定為乳突類圓線蟲。
參考文獻(xiàn)
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[4]Description of a new species,Trichuris ursinus n.sp.(Nematoda:Trichuridae)from Papio ursinus Keer,1792 from South Africa[J].Rocío Callejón;;Ali Halajian;;Cristina Cutillas.Infection,Genetics and Evolution,2017
[5]喻東.七個地區(qū)圈養(yǎng)林麝腸道寄生蟲感染情況調(diào)查及分子生物學(xué)鑒定[D].四川農(nóng)業(yè)大學(xué),2022.