全基因組甲基化測(cè)序(WGBS)概述^[1][2]

DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)（Epigenetics）的重要組成部分，在維持正常細(xì)胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用。全基因組甲基化測(cè)序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS），其采用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA使未甲基化修飾的胞嘧啶C轉(zhuǎn)化為尿嘧啶U，通過對(duì)處理后的DNA進(jìn)行全基因組重測(cè)序，并與參考基因組進(jìn)行比對(duì)，從基因組水平實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率的、高精確度甲基化水平分析，廣泛應(yīng)用于細(xì)胞分化、組織發(fā)育等基礎(chǔ)機(jī)制研究，以及動(dòng)植物育種、人類健康與疾病治療等研究領(lǐng)域。

全基因組甲基化測(cè)序(WGBS)優(yōu)勢(shì)^[1][2]

全基因組甲基化測(cè)序(WGBS)在1992年由Frommer等提出被公認(rèn)為一項(xiàng)革命性的創(chuàng)新，已成為繪制單堿基DNA甲基化圖譜的首選方法。該方法因其通量高、耗時(shí)少、單堿基分辨率、高覆蓋率的優(yōu)勢(shì)被稱為甲基化測(cè)序的“黃金標(biāo)準(zhǔn)”。

測(cè)精度高：?jiǎn)螇A基分辨率，精確分析每一個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài)；

檢測(cè)范圍廣：借助高通量測(cè)序平臺(tái)，對(duì)全基因組范圍內(nèi)甲基化區(qū)域進(jìn)行研究；

可靠性高：直接對(duì)甲基化片段進(jìn)行測(cè)序和定量，無交叉反應(yīng)和背景噪音；

性價(jià)比高：相比傳統(tǒng)PCR+Sanger測(cè)序方法，使用抗體富集高甲基化區(qū)域測(cè)序，費(fèi)用少。

主要參考文獻(xiàn)

1.DNA甲基化測(cè)序技術(shù)及其在哺乳動(dòng)物中的應(yīng)用研究進(jìn)展?！渡飳W(xué)雜志》2018年第5期79-82,86共5頁(yè)。