糖基化是蛋白質(zhì)的一種重要的翻譯后修飾。根據(jù)糖鏈和肽鏈的連接方式的不同 ,蛋白質(zhì)的糖基化可分為 N-糖基化和 O-糖基化。N-糖基化是通過(guò)糖鏈的還原端的 N-乙酰氨基葡萄糖( Glc-NAc) 和肽鏈中某些 Asn 側(cè)鏈酰氨基上的氮原子相連。能接有糖鏈的 Asn 必須處于 Asn-X-Ser/Thr 3 殘基構(gòu)成的基序(motif) 中 ,其中 X 可為除 Pro 的任意的氨基酸殘基。 O-糖基化的結(jié)構(gòu)比 N-糖基化簡(jiǎn)單 ,一般糖鏈較短 ,但是種類比 N-糖基化多得多。肽鏈中可以糖基化的主要是 Ser 和 Thr ,此外還有酪氨酸、羥賴氨酸和羥脯氨酸 ,連接的位點(diǎn)是這些殘基側(cè)鏈上的羥基氧原子。百泰派克生物基于高分辨率質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos,利用包含了幾乎所有糖型的Byonic軟件針對(duì)肽段、蛋白和抗體藥物進(jìn)行糖基化分析,可以確定肽段或者蛋白樣品糖基化位點(diǎn)、N糖/O糖類型、糖基化位點(diǎn)糖組成。
案例分析:
服務(wù)案例為對(duì)一位客戶提供的重組蛋白藥物進(jìn)行糖譜檢測(cè)。拿到客戶提供的理論序列之后,我們首先對(duì)序列進(jìn)行了分析以確認(rèn)適合項(xiàng)目使用的蛋白酶;通常情況下,我們會(huì)選擇兩種以上的蛋白酶進(jìn)行酶切,以提高的肽段覆蓋率;使用不同的蛋白酶進(jìn)行酶切,產(chǎn)生不同的肽段序列,利用肽段序列相互之間的互補(bǔ)關(guān)系,幫助提高糖譜分析的肽譜覆蓋率。以下是之前項(xiàng)目的部分實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),該項(xiàng)目中客戶提供的是重組蛋白樣品,在我們選擇了合適的蛋白酶組合之后,肽段覆蓋率如下圖所示:
該項(xiàng)目中,與理論序列相比,肽段覆蓋率為94%,未鑒定到的6%的序列為信號(hào)肽,在重組蛋白分泌過(guò)程中已經(jīng)被切掉,因此實(shí)際的肽段覆蓋率為100%。
經(jīng)過(guò)Byonic軟件分析之后,鑒定到的糖肽相關(guān)總結(jié)如下:
在結(jié)題報(bào)告中,我們還會(huì)提供鑒定到的每一個(gè)糖肽的二級(jí)質(zhì)譜圖信息,如下圖所示:
中/英文項(xiàng)目報(bào)告
在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:
1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 質(zhì)譜圖片
4. 原始數(shù)據(jù)
5. 糖譜檢測(cè)結(jié)果
生物藥糖譜檢測(cè)一站式服務(wù)
您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告
關(guān)鍵字: 生物藥糖譜檢測(cè);
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡(jiǎn)稱BTP)成立于2015年,是國(guó)家級(jí)高新技術(shù)企業(yè),業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測(cè)兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價(jià)比、高效率的技術(shù)服務(wù)。深耕蛋白鑒定、定量蛋白組(iTRAQ/TMT、label free、DIA/SWATH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗體測(cè)序、蛋白修飾(二硫鍵、糖基化、磷酸化、乙?;?、泛素化等)、靶向和非靶向代謝物檢測(cè)。
百泰派克生物科技檢測(cè)平臺(tái)包括:檢測(cè)分析平臺(tái)、蛋白質(zhì)組學(xué)分析平臺(tái)、代謝組學(xué)分析平臺(tái)、蛋白質(zhì)從頭測(cè)序平臺(tái)、生物制藥分析平臺(tái)和流式細(xì)胞多因子檢測(cè)平臺(tái)。公司擁有獨(dú)立的質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)室、色譜實(shí)驗(yàn)室、細(xì)胞培養(yǎng)室和免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室,以及高分辨率質(zhì)譜儀和高效液相色譜。目前已與國(guó)內(nèi)外多家藥物研發(fā)企業(yè),以及哈佛大學(xué)、北京大學(xué)在內(nèi)的國(guó)內(nèi)外高校建立了合作關(guān)系,協(xié)助客戶發(fā)表了多篇中英文文章,包括Cell等多家高水平期刊。
公司自主檢測(cè)平臺(tái)發(fā)展至今,已覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、生物制藥、生信分析等多組學(xué)檢測(cè)平臺(tái),積累了豐富的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),憑借專業(yè)的技術(shù)和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)水平,客戶覆蓋北京大學(xué)、清華大學(xué)、中科院等多所知名院校,也與國(guó)內(nèi)外多家藥物研發(fā)企業(yè)建立合作關(guān)系。公司始終致力于為各科研院校、企業(yè)和機(jī)構(gòu)提供高效、準(zhǔn)確、高性價(jià)比的蛋白質(zhì)(組)研究技術(shù)包裹,助力客戶在基礎(chǔ)研究、分子診斷及其他生命科學(xué)研究領(lǐng)域取得突破,為生命科學(xué)的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。
百泰派克技術(shù)平臺(tái)
檢測(cè)分析平臺(tái):多臺(tái)高分辨率質(zhì)譜儀、高效液相色譜、氣相色譜,NMR。
蛋白質(zhì)組分析平臺(tái):Label-free、iTRAQ、SILAC、SWATH、MRM;蛋白質(zhì)定性定量鑒定、蛋白質(zhì)差異分析、發(fā)現(xiàn)疾病標(biāo)記物、發(fā)現(xiàn)藥物靶標(biāo)。
代謝組分析平臺(tái):靶向代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、脂質(zhì)組學(xué)分析;通量達(dá)1000種代謝分子、代謝通路分析、代謝靶標(biāo)鑒定。流式細(xì)胞多因子檢測(cè)平臺(tái):CBA、FlowCytomix;微量樣品需求,分析多種細(xì)胞因子。
蛋白質(zhì)從頭測(cè)序平臺(tái):Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀、PEAKS軟件分析;100%序列測(cè)定,精準(zhǔn)蛋白、抗體測(cè)序。
生物制藥分析平臺(tái):生物藥物鑒定、變異性分析、純度分析。
流式細(xì)胞多因子檢測(cè)平臺(tái):CBA、FlowCytomix;微量樣品需求,分析多種細(xì)胞因子。
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