DNA5’末端標(biāo)記試劑盒
產(chǎn)品及特點(diǎn)本產(chǎn)品為 DNA 5’末端標(biāo)記系統(tǒng),利用 T4 Polynucleotide Kinase(T4 多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 對粘性末端或平末端的 DNA 或 RNA 的 5’ 末端進(jìn)行高效標(biāo)記反應(yīng)。原理如下: 本產(chǎn)品具有下列特點(diǎn):
1. 使用本試劑盒之前,不需要對 5’末端的磷酸基團(tuán)進(jìn)行去磷酸化處理,因 為使用的 kinase 能使 5’末端的磷酸與[γ-32P]ATP 的γ-磷酸進(jìn)行交換。
2. 合成的單鏈或雙寡核苷酸的 5’末端游離的 OH 基團(tuán)都能通過 Kinase 反 應(yīng)被標(biāo)記(或者只是簡單的磷酸化)。
3. 提供的兩種反應(yīng)液使交換反應(yīng)和磷酸化反應(yīng)都能高效進(jìn)行,均能得到大于 106 cpm/pmol(5’-end)的比活性。
規(guī)格及成分 成份 編號 熱封袋包裝
T4 多聚核苷酸激酶(10 U/μL) 131036A 20 μL
5×交換反應(yīng)緩沖液 131036B 100 μL
10×磷酸緩沖液 131036C 50 μL
Control DNA 131036D 20 μL
使用手冊 1 份
運(yùn)輸及保存 低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑 DNA 片段、[γ-32P]ATP 或其它的標(biāo)記、未標(biāo)記的 ATPs、牛小腸堿性磷酸 酶(CIAP)等
使用方法 一、交換反應(yīng) 1. 實(shí)驗(yàn)前需自備的試劑:7 M 醋酸銨、100%乙醇、70%乙醇等 2. 在微量離心管中制備下列反應(yīng)液: 成分 加入的體積 自備的 5’磷酸化 DNA 片段 14 μL(≤5 pmoles 的 5′末端) 5×交換反應(yīng)緩沖液 5 μL [γ -32P] ATP 5 μL T4 多聚核苷酸激酶(10 U/μL) 1 μL 滅菌的超純水 補(bǔ)足到 25 μL 注:5 pmoles 的 5’末端約等于 0.17 μg 的長 100 bp 的雙鏈 DNA。 3. 37℃反應(yīng) 30 分鐘。 4. 70℃加熱 5~10 分鐘使酶失活。 5. 加入 10 μL 的 7 M CH3COONH4(pH 4.5)。如使用 CH3COONa 做 乙醇沉淀時(shí)使其終濃度達(dá) 300 mM。 6. 加入 87.5 μL(2.5 倍)的冷無水乙醇,-20℃放置 30~60 分鐘。 7. 離心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
8. 用適當(dāng) Buffer 溶解沉淀。 注:通過第 5~8 步操作幾乎可以除去大部分未反應(yīng)的[γ-32P] ATP,如要 完全將其除去時(shí),乙醇沉淀后用凝膠過濾等方法精制即可。如需用苯酚抽 提除去蛋白質(zhì)時(shí),請?jiān)诘?8 步之后進(jìn)行。
二、磷酸化反應(yīng)標(biāo)記 A. 去磷酸化反應(yīng) 1. 實(shí)驗(yàn)前需自備的試劑:TE 飽和酚/氯仿、
3 M NaCl 、100%乙醇、70% 乙醇、牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)等 2. 在微量離心管中制備下列反應(yīng)液: 成分 加入的體積 自備的 DNA 片段 133 μL(≤10 μg) 1 M Tris-HCl,pH 8.0 15 μL 牛小腸堿性磷酸酶 (CIAP,10~20 U/μL) 2 μL 滅菌的超純水 補(bǔ)足到 150 μL 3. 50℃反應(yīng) 30 分鐘。
4. 加入 150 μL 的 TE 飽和酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),充分混勻。
5. 離心,取上層(水層)移到另一個(gè)微量離心管中。
6. 重復(fù)操作 4~5。
7. 加入 7.5 μL 的 3 M NaCl(最終濃度 150 mM)。
8. 加入 375 μL(2.5 倍量)的冷無水乙醇,-20℃放置 30~60 分鐘。
9. 離心回收沉淀,用 1 mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
10. 使用 20 μL 的 TE Buffer 溶解沉淀。
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