一步式探針法qRT-PCR試劑盒
產(chǎn)品及特點
本產(chǎn)品是基于熒光探針檢測的即用型 RT-PCR 試劑盒,可以對靶 RNA 分子進行實時定量 RT-PCR 分析(quantitative RT-PCR、qRT-PCR)。產(chǎn)品含有經(jīng)過優(yōu)化的緩沖液組分、逆轉(zhuǎn) 錄酶、熱啟動 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 穩(wěn)定劑、dNTPs、MgCl2和穩(wěn)定劑等所有實時定 量 RT-PCR 所需要的成分,用戶只需加入 RNA 模板、引物和探針即可進行探針法實時定量 RT-PCR 反應(yīng),具有廣泛的用途。
本產(chǎn)品具有下列特點:1. 以 2×Mix 提供,用戶只需準備模板、引物、探針和 ROX 染料(取決于 qPCR 儀器)即 可以進行探針法實時定量 RT-PCR 實驗,非常方便快捷,降低了操作誤差。 2. 各成分的濃度和比例都經(jīng)過精心優(yōu)化,反應(yīng)的靈敏度高,特異性強。靈敏度最高時可以達 到 50 拷貝/反應(yīng)(跟模板質(zhì)量,引物設(shè)計等相關(guān))。 3. 既可用于TaqMan探針qRT-PCR,也可以是分子信標(molecular beacon)的qRT-PCR。 4. 靈敏度和專一性比染料法熒光定量 RT-PCR 更高。 5. 可用于基因表達分析、SNP 分析、拷貝數(shù)分析等實驗。也可以用于定性檢測。 6. 本產(chǎn)品只能用于科研,1mL 足夠 100 次 20uL 體系的探針法 qRT-PCR 反應(yīng)。
規(guī)格及成分 1 mL 規(guī)格 成 份 編 號 塑料袋包裝 2×探針法 qRT-PCR 緩沖液 190504a 1 mL(橙色蓋) 5×探針法 qRT-PCR 酶混合液 190504b 0.2 mL(紅色蓋) 使用手冊 190504sc 1 份 10mL 規(guī)格 成 份 編 號 十孔盒包裝 2×探針法 qRT-PCR 緩沖液 190504a 1 mL×10(橙色蓋) 5×探針法 qRT-PCR 酶混合液 190504b 0.2 mL×10(紅色蓋) 使用手冊 190504sc 1 份 運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存, 不凍融時保存期限為 12 個月。如果需要每天使用,可在 4℃放置三周。
自備試劑 RNA 模板、引物、TaqMan 探針、超純水。
使用方法1. 如果有 N 個樣品并且做定量分析,設(shè)置 N+7 個反應(yīng),多出的 7 個中,6 個是做標準 曲線的陽性對照,一個是陰性對照(NC)。在 N+7 個 PCR 管中,加入下列成分。如果是 做定性分析,則 6 個做標準曲線的樣品縮減成一個陽性對照(PC),用戶自己需要根據(jù)下 表進行適當修改(把 6 個標曲反應(yīng)改成 1 個陽性對照反應(yīng))。 成分 N 個樣品管 6 個標準 曲線管 NC 管 2×探針法 qRT-PCR 緩沖液 各 10 uL 各 10 uL 10 uL 自備引物 1(10uM) 各 1 uL 各 1 uL 1 uL 自備引物 2(10uM) 各 1 uL 各 1 uL 1 uL N 個自備模板 RNA 各 1-2 uL 不加 不加 自備陽性對照模板(6 個梯度) 不加 各 1 uL(1 管 加 1 個梯度) 不加 陰性對照模板(水) 不加 不加 1 uL 自備探針(0.5uM) 各 1 uL 各 1 uL 1 uL 自備 50×ROX I 染料 或 自備 50×ROX II 染料(見注) 各 0.4 uL 各 0.4 uL 0.4 uL 5×探針法 qRT-PCR 酶混合液 2 uL 2 uL 2 uL 補超純水到 20 uL 20 uL 20 uL 注,下列信息僅供參考,具體以 qPCR 儀器的使用手冊為準。 1、不需要 ROX 的機型:Agilent MX3000 和 MX4000、iCycler IQ、LightCycler 480、,、 Smart Cycler System、Thermal Cycler Dice Real Time System 等型號的熒光 PCR 儀器 不需要加 ROX 染料,但加入的話也不會影響整個 PCR 分析。
2、需要使用 ROX I 的機型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step One、Step One Plus。
3、需要使用 ROX II 的機型:ABI Prism7500、7500 Fast、MJ Opticon、MJ Chromo4、 Corbett RotorGene 3000。 2. 放入熒光 PCR 儀中進行擴增, 下表的擴增參數(shù)僅供參考,一定需要根據(jù)靶分子長度,引物 和探針的 Tm 值、標記染料的種類等進行調(diào)節(jié)。一般選擇三步法 PCR: 步驟 反應(yīng)參數(shù) 備注 逆轉(zhuǎn)錄(RT 步驟) 94℃ 30 分鐘 預變性 94℃ 2 分鐘 PCR(35-45 次循環(huán)) 94℃ 15 秒 靶分子 長 度 最 好 在 80-200bp 55-65℃ 15-30 秒 在此步采集熒光信號,通 道根據(jù)標記染料決定 72℃ 30 秒 如果引物 Tm 值接近 60℃,也可以選擇兩步法 PCR: 步驟 反應(yīng)參數(shù) 備注 逆轉(zhuǎn)錄(RT 步驟) 94℃ 30 分鐘 預變性 94℃ 2 分鐘 PCR(35-45 次循環(huán)) 94℃ 15 秒 靶分子 長 度 最 好 在 80-200bp 60℃ 30-60 秒 在此步采集熒光信號,通 道根據(jù)標記染料決定
3. 數(shù)據(jù)處理如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪 制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 DNA 濃度的 log 值,再推算 出其濃度。 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性。一般情況下,陰性對照 Ct 大于或等 于 40(閾值需要以陰性對照的 Ct 值確定,此處為便于敘述以 40 為例,具體情況很可能 閾值不一樣)。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。 對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct 值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 40, 則為陽性。
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品 染料法 qPCR MagicMix
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