酵母基因組DNA提取試劑盒
Yeast DNA Kit
● 試劑盒內(nèi)容及保存:
● 儲(chǔ)存條件和效期:
室溫保存,12個(gè)月內(nèi)有效。Proteinase K與Lyticase-20℃保存。緩沖液 YBL與緩沖液 YL可能有沉淀產(chǎn)生,37度水浴溶解后即可。
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
酵母DNA提取試劑盒(Yeast DNA Kit)采用了一種新型的硅膠柱。在特定條件下,使DNA能在離心過(guò)柱的瞬間,結(jié)合到純化柱上,在一定條件下又能將DNA充分洗脫,從而實(shí)現(xiàn)DNA的快速純化。無(wú)需酚氯仿抽提,無(wú)需酒精沉淀。純化的DNA可直接用于PCR、Southern雜交和酶切等。
● 準(zhǔn)備工作:
1. 準(zhǔn)備30℃,65℃,70℃水浴;無(wú)水乙醇;制冰機(jī);1.5ml離心管;2ml離心管
2. 按照標(biāo)簽所示在DNA Wash Buffer中加入無(wú)水乙醇,混勻后蓋緊瓶蓋后室溫貯存?zhèn)溆谩?/p>
3. 每次使用前請(qǐng)檢查緩沖液YBL,緩沖液YL是否有沉淀生成,如果出現(xiàn)沉淀,37℃溫浴至沉淀溶解后再使用。
● 標(biāo)準(zhǔn)操作步驟:
如非指出,所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。
1. 取1-3 ml 酵母培養(yǎng)物(不超過(guò)3×107 酵母細(xì)胞),12,000 rpm (~13,400×g )離心1分鐘,盡量吸除上清(菌液較多時(shí)可以通過(guò)幾次離心將菌體沉淀收集到一個(gè)離心管中)。
注:可用分光光度計(jì)或平板培養(yǎng)法檢測(cè)菌體量,一般對(duì)于釀酒酵母OD600值為1.0時(shí),相當(dāng)于1-2×107cell/ml。
2. 加入480 μl 緩沖液 SE,完全重懸細(xì)胞。加入30μl Lyticase溶液。30℃水浴處理30min。期間振蕩幾次。
注意:以處理時(shí)間為經(jīng)驗(yàn)值,根據(jù)酵母菌株和酵母細(xì)胞數(shù)量的不同,孵育時(shí)間應(yīng)該進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。
3. 4000 rpm(~1500×g)離心10鐘,棄上清,收集沉淀。加入200μl 緩沖液 YL重懸。加入50mg Glass Beads,劇烈渦旋5min。
4. 加入20μl 蛋白酶K,混勻。65℃水浴孵育直至裂解完全,孵育過(guò)程中,渦旋幾次。一般來(lái)說(shuō)1小時(shí)以?xún)?nèi)能徹底裂解。
5. 可選步驟:加入5μl RNaseA并反復(fù)顛倒混勻,在室溫條件下孵育5分鐘。
6. 12,000 rpm (~13,400×g )離心1分鐘,轉(zhuǎn)移上清至新的離心管中。
7. 加入220 μl 緩沖液 YBL,振蕩15 秒,70℃放置10 分鐘,溶液應(yīng)變清亮。
注意:加緩沖液YBL 時(shí)可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,一般70℃放置時(shí)會(huì)消失,不會(huì)影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如溶液未變清亮,說(shuō)明細(xì)胞裂解不徹底,可能導(dǎo)致提取DNA量少和提取出的DNA不純。
8. 加220 μl 無(wú)水乙醇,充分混勻,此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀。
9. 將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30 秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。
10. 向吸附柱中加入500 μl 緩沖液 WB,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30 秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。
11. 向吸附柱 中加入600 μl DNA Wash Buffer(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入無(wú)水乙醇),12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30秒,倒掉廢液,吸附柱放入收集管中。
12. 向吸附柱中加入600 μl DNA Wash Buffer,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心30秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。
13. 12,000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。
14. 將吸附柱轉(zhuǎn)入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200 μl 洗脫緩沖液EB或滅菌去離子水,室溫放置2-5分鐘,12,000 rpm (~13,400×g ) 離心1分鐘,將溶液收集到離心管中。
注:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于50 μl,體積過(guò)小影響回收效率。洗脫液的pH值對(duì)于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液應(yīng)保證其pH 值在7.0-8.5 范圍內(nèi)(可以用NaOH將水的pH 值調(diào)到此范圍),pH 值低于7.0 會(huì)降低洗脫效率;
15. DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,以防DNA降解。
● DNA濃度及純度檢測(cè):
基因組DNA片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過(guò)程中的剪切力等因素有關(guān)。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度??膳渲?.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小,完整的基因組大小應(yīng)在23kb以上。使用分光光度計(jì)檢測(cè)時(shí), OD260/OD280比值應(yīng)為1.7–1.9之間,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水洗脫,比值可能偏低,但并不表明DNA純度不高。
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