由于miRNA(microRNA)分子序列較小,僅20nt左右,沒有真核生物特有的Poly(A)尾巴結(jié)構(gòu),采用傳統(tǒng)Oligo dT引物和隨機(jī)引物很難獲得從miRNA到cDNA的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。目前普遍采用的解決方案有兩種:特異性反轉(zhuǎn)錄引物(下圖A所示)、兩步加A法反轉(zhuǎn)錄方案(下圖B所示)。Biorab公司開發(fā)出一套全新的一步法miRNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒,可以對(duì)成熟的miRNA同時(shí)完成Poly(A)反應(yīng)和反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),直接獲得含有特異性tag和15(T)的cDNA產(chǎn)物(下圖C所示)。該方法使得miRNA反轉(zhuǎn)錄與mRNA的反轉(zhuǎn)錄一樣輕松,直接將提取的microRNA與反應(yīng)緩沖液混合物混合并置于PCR儀上1小時(shí)即可獲得高濃度的、包含所有miRNA分子的cDNA產(chǎn)物,獲得的cDNA產(chǎn)物適合于采用SYBR Green染料法進(jìn)行RealTime PCR進(jìn)行定量檢測。
產(chǎn)品組成:
組分
MT0005A(25T)
MT0005B(100T)
4×One step miRNA RT Solution
125μl
500μl
10×miRNA RT Primer
50μl
200μl
儲(chǔ)存:請置于-20℃,可保存2年,避免反復(fù)凍融。
注:如4×One step miRNA RT Solution出現(xiàn)沉淀屬正?,F(xiàn)象,可用手捂化,混合均勻后使用不影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
特別說明: 10×miRNA RT Primer 引物為5'-CAGGTCCAGTTTTTTTTTTTTTTTVN-3',定量擴(kuò)增用特異性上下游引物進(jìn)行擴(kuò)增,下圖2是以 hsa-miR-21 為實(shí)例說明特異性上下游引物的設(shè)計(jì)方法(Biorab的microRNA 熒光定量 PCR 試劑盒提供所有 miRNA 檢測,貨號(hào):MTAXXXXX,所有引物均經(jīng)過設(shè)計(jì)優(yōu)化,詳細(xì)請于引物列表中查詢。如果您研究的miRNA分子不在列表中,請來信咨詢,我們將及時(shí)給您優(yōu)化設(shè)計(jì))。
圖1:技術(shù)原理圖:
圖2:hsa-miR-21實(shí)例設(shè)計(jì)原理:
操作方法:
1.按以下組分配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液:
4×One step miRNA RT Solution
5μl
Rnase-Free H2O
Up to 20μl
2. 在PCR 儀上按以下條件進(jìn)行反應(yīng):
37℃——————60min
95℃——————5分鐘
3.獲得 cDNA 產(chǎn)物后使用microRNA 熒光定量 PCR 試劑盒進(jìn)行 miRNA 定量檢測。使用該試劑盒反轉(zhuǎn)錄所得 cDNA 產(chǎn)物包含了樣品中所有miRNA 反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,可用于多個(gè)基因的檢測分析,可使用內(nèi)參基因進(jìn)行定量矯正。內(nèi)參基因可選擇使用RNU6B miRNA 熒光定量 PCR 試劑盒(貨號(hào):MTA01501),適用于來源于人和鼠等哺乳動(dòng)物的樣品;RNU44 miRNA 熒光定量 PCR 試劑盒(貨號(hào):MTA01502)、 RNU48 miRNA 熒光定量 PCR 試劑盒(貨號(hào):MTA01503),適用于來源于人的樣品;SnoRNA135 miRNA 熒光定量 PCR 試劑盒(貨號(hào):MTA01504) 、SnoRNA202 miRNA 熒光定量 PCR 試劑盒(貨號(hào):MTA01505)適用于來源于鼠的樣品。Biorab 提供的內(nèi)參擴(kuò)增引物濃度均為 10μM,每 20μl 反應(yīng)體系中加入0.4-0.8μl。
根據(jù)機(jī)型選擇步驟A或B,配制反應(yīng)體系:
步驟A: 需要添加 ROX 染料進(jìn)行反應(yīng)孔間信號(hào)矯正的Real-Time PCR 儀,包括:ABI PRISM7000/7700/7900HT,7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR(Applied Biosystems);Mx3000P(Stratagene)等。按照如下組分配制 20μl PCR 反應(yīng)體系:
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix
4μl
1×
50×ROX Reference Dye
0.4μl
1×
PCR Forward Primer(10μM)
0.4-0.8μl
PCR Reverse Primer(10μM)
0.4-0.8μl
注:引物初次使用請用0.4μl,視實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行調(diào)整。
步驟B:無需添加 ROX 染料進(jìn)行反應(yīng)孔間信號(hào)矯正的Real-Time PCR 儀,包括:LightCycler(Roche Diagnostics);MiniOpticon、Opticon2、MyiQ 2、CFX96 Real-Time PCR(Bio-Rad & MJ);Line-Gene(Bioer,杭州博日)等。按照如下組分配制 20μl PCR 反應(yīng)體系:
5×Top HS SYBR Green qPCR Mix
4μl
1×
PCR Forward Primer(10μM)
0.4-0.8μl
PCR Reverse Primer(10μM)
0.4-0.8μl
4.進(jìn)行 Real-Time PCR 反應(yīng),通常采用兩步法,程序如下:
步驟
加入量
終濃度
循環(huán)數(shù)
Stage 3:
Dissociation analysis
注意:使用該方法通??梢詼?zhǔn)確檢測到>0.01fM的microRNA 分子,過多的循環(huán)數(shù)會(huì)造成精確性降低。推薦的循環(huán)數(shù)為 30 個(gè),在檢測極低樣品濃度時(shí)可將循環(huán)數(shù)調(diào)整到35 個(gè)。
5.?dāng)U增結(jié)果分析和數(shù)據(jù)處理:
反應(yīng)結(jié)束后確認(rèn) Real-Time PCR的cDNA 樣品和 NTC 陰性對(duì)照的擴(kuò)增曲線和融解曲線。
關(guān)鍵字: 一步法microRNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒_microRNA_活體檢測_
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