自然界中的微生物多如恒河沙數(shù),且其中絕大多數(shù)無法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過了十萬種,這還是一個(gè)正在急劇擴(kuò)大著的數(shù)字。DNA測(cè)序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準(zhǔn)確、快捷,不依賴菌種本身特點(diǎn),對(duì)所有菌種均可使用。晶能憑借先進(jìn)的測(cè)序儀器和多年的微生物檢測(cè)經(jīng)驗(yàn),為您可提供快速、高效、權(quán)威的微生物檢測(cè)服務(wù),包括細(xì)菌16S rDNA測(cè)序、真菌18S rDNA測(cè)序、ITS測(cè)序。
16S rDNA測(cè)序 — 作為一種應(yīng)用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標(biāo)基因測(cè)序技術(shù),通過針對(duì)覆蓋16SrDNA的1個(gè)或多個(gè)連續(xù)可變性區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增測(cè)序來鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu),Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺(tái)可以針對(duì)16S rDNA的1個(gè)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序, 具有對(duì)樣本更高的測(cè)序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費(fèi)用的優(yōu)勢(shì)完成科研項(xiàng)目。
18S rDNA測(cè)序 — 18S rDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA(18S rRNA)的DNA序列,其高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。通過分析18S rDNA序列,在較高級(jí)別上確定樣品的歸屬。
ITS(internal transcribed spacer )測(cè)序 — 真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer ,ITS),又叫內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),是位于真菌核糖體DNA(rDNA)上18S 和28S 基因之間的區(qū)域片段,主要包括內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1(ITS1)、5.8S rDNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(ITS2),其兩側(cè)分別是18S RNA 基因和28S RNA 基因。
ITS序列由于選擇壓力小,在自然中變異較快,在絕大多數(shù)真菌中表現(xiàn)出序列多態(tài)性,表現(xiàn)為種內(nèi)相對(duì)一致,種間差異比較明顯,非常適合真菌鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育分析。由于ITS鑒定快速,分析準(zhǔn)確,有效彌補(bǔ)了傳統(tǒng)鑒定方法的不足,ITS 的序列分析能實(shí)質(zhì)性地反映出屬間、種間以及菌株間的堿基對(duì)差異,易于分析,目前已被廣泛應(yīng)用于真菌屬內(nèi)不同種間或近似屬間的系統(tǒng)發(fā)育研究中。
晶能優(yōu)勢(shì)
1) 擁有Miseq測(cè)序平臺(tái),高質(zhì)量、高性價(jià)比的完成客戶項(xiàng)目。
2) 多項(xiàng)相關(guān)項(xiàng)目的經(jīng)驗(yàn),為客戶的項(xiàng)目提供保障。
關(guān)鍵字: 微生物種群鑒定測(cè)序(16S/18S/ITS)
晶能生物技術(shù)(上海)有限公司(簡稱"晶能生物")是博愛新開源醫(yī)療科技股份有限公司全資子公司(股票代碼:300109),是一家專注于醫(yī)療、健康、科技服務(wù)技術(shù)研發(fā)和應(yīng)用的高新技術(shù)企業(yè)。
晶能生物擁有國際先進(jìn)的高通量測(cè)序,基因芯片,單分子光學(xué)圖譜,生物信息和分子生物學(xué)技術(shù)平臺(tái),專業(yè)提供科技服務(wù)整體解決方案和健康臨床服務(wù)。晶能生物通過國際ISO9001:2008質(zhì)量體系認(rèn)證和國家3A企業(yè)信用認(rèn)證,加盟上海研發(fā)公共平臺(tái),獲得上海高新技術(shù)企業(yè),發(fā)明專利和軟件著作權(quán)16項(xiàng)。
晶能生物抓住中國醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)快速成長的巨大機(jī)遇,成立"晶能創(chuàng)新醫(yī)療健康研究中心",研發(fā)團(tuán)隊(duì)囊括國際頂尖科學(xué)家,中國國家千人計(jì)劃學(xué)者以及國內(nèi)知名院校醫(yī)院在內(nèi)的資