自然界中的微生物多如恒河沙數(shù),且其中絕大多數(shù)無法在實驗室培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過了十萬種,這還是一個正在急劇擴大著的數(shù)字。DNA測序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準確、快捷,不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用。晶能憑借先進的測序儀器和多年的微生物檢測經(jīng)驗,為您可提供快速、高效、權(quán)威的微生物檢測服務,包括細菌16S rDNA測序、真菌18S rDNA測序、ITS測序。
16S rDNA測序 — 作為一種應用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標基因測序技術,通過針對覆蓋16SrDNA的1個或多個連續(xù)可變性區(qū)域進行PCR擴增測序來鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu),Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺可以針對16S rDNA的1個區(qū)域進行測序, 具有對樣本更高的測序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費用的優(yōu)勢完成科研項目。
18S rDNA測序 — 18S rDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA(18S rRNA)的DNA序列,其高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。通過分析18S rDNA序列,在較高級別上確定樣品的歸屬。
ITS(internal transcribed spacer )測序 — 真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer ,ITS),又叫內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),是位于真菌核糖體DNA(rDNA)上18S 和28S 基因之間的區(qū)域片段,主要包括內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1(ITS1)、5.8S rDNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(ITS2),其兩側(cè)分別是18S RNA 基因和28S RNA 基因。
ITS序列由于選擇壓力小,在自然中變異較快,在絕大多數(shù)真菌中表現(xiàn)出序列多態(tài)性,表現(xiàn)為種內(nèi)相對一致,種間差異比較明顯,非常適合真菌鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育分析。由于ITS鑒定快速,分析準確,有效彌補了傳統(tǒng)鑒定方法的不足,ITS 的序列分析能實質(zhì)性地反映出屬間、種間以及菌株間的堿基對差異,易于分析,目前已被廣泛應用于真菌屬內(nèi)不同種間或近似屬間的系統(tǒng)發(fā)育研究中。
晶能優(yōu)勢
1) 擁有Miseq測序平臺,高質(zhì)量、高性價比的完成客戶項目。
2) 多項相關項目的經(jīng)驗,為客戶的項目提供保障。
關鍵字: 微生物種群鑒定測序(16S/18S/ITS)
晶能生物技術(上海)有限公司(簡稱"晶能生物")是博愛新開源醫(yī)療科技股份有限公司全資子公司(股票代碼:300109),是一家專注于醫(yī)療、健康、科技服務技術研發(fā)和應用的高新技術企業(yè)。
晶能生物擁有國際先進的高通量測序,基因芯片,單分子光學圖譜,生物信息和分子生物學技術平臺,專業(yè)提供科技服務整體解決方案和健康臨床服務。晶能生物通過國際ISO9001:2008質(zhì)量體系認證和國家3A企業(yè)信用認證,加盟上海研發(fā)公共平臺,獲得上海高新技術企業(yè),發(fā)明專利和軟件著作權(quán)16項。
晶能生物抓住中國醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)快速成長的巨大機遇,成立"晶能創(chuàng)新醫(yī)療健康研究中心",研發(fā)團隊囊括國際頂尖科學家,中國國家千人計劃學者以及國內(nèi)知名院校醫(yī)院在內(nèi)的資