Cy3 (Cyanine 3) 是一種發(fā)橘黃色熒光的花青素熒光染料。它的熒光很亮，并且對pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激發(fā)然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用。標記后，Cy3的背景熒光一般認為比TAMRA等TRITC系列的染料低。 Cy3可以用來標記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等。
伯胺基(primary amine)是生物標記反應中常用的基團。蛋白表面賴氨酸側鏈(residue)官能團就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester),異氰酸酯(-N=C=S，isothiocyanate)或其它活化基團反應生成穩(wěn)定鏈接，從而把Cy3分子連接到目標分子上。
Cy3-伯胺的水溶性較低，所以在水相的標記反應體系內需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy3-伯胺。兩者的光譜性質幾乎一致，因此大部分應用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標記反應體系內不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標記效率。
Cy3-伯胺標記后的產物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似熒光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY? TMR-X等。
英文名：cy3-NH2
NH2-CY3
Cyanine3 amine
中文名：花青素CY3氨基
CAS號：2247688-56-6
分子式：C36H52Cl2N4O
分子量：627.73
結構式：
ex/em：554/566 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε)：150000 L?mol?1?cm?1
產率(Φ)：0.04
外觀：紅色粉末
溶解性：可溶于甲醇，DMF等有機溶劑，微溶于水
保存條件：避光，干燥，-20℃保存
運輸條件：低溫運輸
簡介：菁3胺是一種含游離氨基的功能化菁染料。氰基3是Cy3的類似物。該試劑的氨基可與NHS酯、羧基（碳化二亞胺活化后）和環(huán)氧化物等反應基團共軛。氨基染料以鹽的形式提供，并具有一定的水溶性。
注意事項：
1）Cy3-伯胺水溶性較低，標記反應可在有機溶劑中進行或者含有機助溶劑的水相中進行。
2）標記時使用不含氨基的緩沖體系，比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會和Cy3上的伯胺競爭。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應。
3）標記反應不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。
相關化合物：
Sulfo-Cyanine3 azide
1658416-54-6
Sulfo-Cyanine3 maleimide
1656990-68-9
Sulfo-Cyanine3 carboxylic acid
1121756-11-3
Zy3 carboxylic acid
146368-13-0
Cyanine3 amine
2247688-56-6
Sulfo-Cyanine5 amine
2183440-44-8
Sulfo DBCO-amine
2028284-70-8
Sulfo-Cyanine7 amine
2236573-39-8
Sulfo DBCO-PEG4-amine
2055198-05-3
關鍵字： 2247688-56-6;Cyanine3 amine;cy3 NH2;Cy3 amine;
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