RNA提取和DNA提取 實(shí)驗(yàn)在分子生物學(xué)中比較常用，但有時(shí)會(huì)出現(xiàn)產(chǎn)量低、純度低、易降解等情況，下面就實(shí)驗(yàn)中常見問題及實(shí)驗(yàn)過程中的注意事項(xiàng)做以匯總：
一、RNA提取和DNA提取實(shí)驗(yàn)中常見問題
1.產(chǎn)量低
如果您遇到的 DNA/RNA 產(chǎn)量低于您對(duì)樣品的預(yù)期，則需要考慮許多因素。通常，這是一個(gè)裂解問題。不完全裂解是產(chǎn)量低的主要原因。它也可能是由不正確的綁定條件引起的。確保使用新鮮的優(yōu)質(zhì)乙醇（100% 200 標(biāo)準(zhǔn)）稀釋緩沖液或添加到結(jié)合的步驟。劣質(zhì)乙醇或舊庫存可能已經(jīng)吸收了水分，并且濃度不正確。如果洗滌緩沖液制備不正確，您可能正在洗掉提取的 DNA 或 RNA 。
2.低純度
如果提取的 DNA 被蛋白質(zhì)污染（低 260/280），那么您可能開始時(shí)樣品過多，而蛋白質(zhì)沒有完全去除或溶解。
如果 DNA 的 260/230 比率不佳，則問題通常是結(jié)合或洗滌緩沖液中的鹽分。確保使用最高質(zhì)量的乙醇來制備洗滌緩沖液，如果問題仍然存在，請(qǐng)?jiān)俅蜗礈焐V柱。
與其他樣品相比，一些樣品含有更多的抑制劑。環(huán)境樣品特別容易出現(xiàn)純度問題，因?yàn)楦迟|(zhì)在提取過程中會(huì)被溶解。
腐殖質(zhì)的行為與 DNA 相似，很難從硅膠柱中去除。
3.降解
降解問題是RNA制備中常常到的問題。因?yàn)樵?RNA 提取過程中，樣品儲(chǔ)存不當(dāng)或裂解效率低等情況都會(huì)導(dǎo)致降解。 對(duì)于 DNA 提取，降解不是一個(gè)大問題，因?yàn)閷?duì)于 PCR，DNA 可以被剪切并且工作正常，如果 不希望有較多剪切的 DNA，可以使用弱裂解的方法。
二、PCR 清理時(shí)的注意事項(xiàng)
PCR 凈化其實(shí)并不是 DNA 提取技術(shù)本身，但它是一種效率高且簡單的技術(shù)，它只是添加高濃度的結(jié)合鹽（通常每體積 PCR 反應(yīng) 3-5 體積鹽）和離心來過濾。
在實(shí)驗(yàn)過程中，PCR Clean-up 試劑盒出現(xiàn)故障也會(huì)導(dǎo)致整個(gè)實(shí)驗(yàn)功虧一簣。
因?yàn)樵赑CR 反應(yīng)中有較多吸收 260 度紫外線的物質(zhì)，比如：核苷酸、去污劑、鹽和引物。所以，PCR 凈化試劑盒經(jīng)常無法正常工作可能是由于 PCR 反應(yīng)失敗所造一般成較難清理。
