背景[1-3]
G蛋白偶聯(lián)受體ARHGEF18抗體是一類(lèi)可以特異性結(jié)合G蛋白偶聯(lián)受體ARHGEF18的多克隆抗體,主要用于G蛋白偶聯(lián)受體ARHGEF18的體外檢測(cè)。
G蛋白偶聯(lián)受體(G Protein-Coupled Receptors,GPCRs)是一大類(lèi)膜蛋白受體的統(tǒng)稱(chēng)。這類(lèi)受體的共同點(diǎn)是其立體結(jié)構(gòu)中都有七個(gè)跨膜α螺旋,且其肽鏈的C端和連接(從肽鏈N端數(shù)起)第5和第6個(gè)跨膜螺旋的胞內(nèi)環(huán)(第三個(gè)胞內(nèi)環(huán))上都有G蛋白(鳥(niǎo)苷酸結(jié)合蛋白)的結(jié)合位點(diǎn)。目前為止,研究顯示G蛋白偶聯(lián)受體只見(jiàn)于真核生物之中,而且參與了很多細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。在這些過(guò)程中,G蛋白偶聯(lián)受體能結(jié)合細(xì)胞周?chē)h(huán)境中的化學(xué)物質(zhì)并激活細(xì)胞內(nèi)的一系列信號(hào)通路,最終引起細(xì)胞狀態(tài)的改變。已知的與G蛋白偶聯(lián)受體結(jié)合的配體包括氣味,費(fèi)洛蒙,激素,神經(jīng)遞質(zhì),趨化因子等等。這些受體可以是小分子的糖類(lèi),脂質(zhì),多肽,也可以是蛋白質(zhì)等生物大分子。
G蛋白偶聯(lián)受體機(jī)構(gòu)圖
G蛋白偶聯(lián)受體的下游信號(hào)通路有多種。與配體結(jié)合的G蛋白耦聯(lián)受體會(huì)發(fā)生構(gòu)象變化,從而表現(xiàn)出鳥(niǎo)苷酸交換因子(GEF)的特性,通過(guò)以三磷酸鳥(niǎo)苷(GTP)交換G蛋白上本來(lái)結(jié)合著的二磷酸鳥(niǎo)苷(GDP)使G蛋白的α亞基與β、γ亞基分離。這一過(guò)程使得G蛋白(特別地,指其與GTP結(jié)合著的α亞基)變?yōu)榧せ顮顟B(tài),并參與下一步的信號(hào)傳遞過(guò)程。具體的傳遞通路取決于α亞基的種類(lèi)(Gαs,Gαi/o,Gαq/11,Gα12/13),其中兩個(gè)主要的通路分別涉及第二信使環(huán)腺苷酸(cAMP)和磷脂酰肌醇。
應(yīng)用[4][5]
用于基于單細(xì)胞RNA-seq的小鼠腎小球固有細(xì)胞必需基因的分析研究
通過(guò)FluidigmC1單細(xì)胞捕獲和cDNA制備平臺(tái),獲得小鼠腎小球單細(xì)胞cDNA樣品,并對(duì)其中14個(gè)系膜細(xì)胞和20個(gè)足細(xì)胞cDNA樣品進(jìn)行了測(cè)序分析。對(duì)20個(gè)足細(xì)胞的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析。足細(xì)胞的單細(xì)胞測(cè)序分析結(jié)果同樣揭示了任意兩個(gè)足細(xì)胞間基因表達(dá)的巨大差異,相關(guān)系數(shù)為0.27±0.035(MEAN±SD)。
總共發(fā)現(xiàn)335個(gè)20個(gè)足細(xì)胞共同表達(dá)的基因(RPKM>0.5),即足細(xì)胞必需基因。在這335個(gè)基因中,有239個(gè)同樣在腎小球系膜細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞中表達(dá),GO分析發(fā)現(xiàn)它們主要參與能量代謝、蛋白質(zhì)合成等生物學(xué)過(guò)程,因而是管家基因。
此外,92個(gè)基因主要在足細(xì)胞中表達(dá);為驗(yàn)證它們是足細(xì)胞特異的必需基因,我們通過(guò)多種方法對(duì)其進(jìn)行分析,包括生物信息學(xué)分析、在人類(lèi)足細(xì)胞中表達(dá)保守性的檢驗(yàn)、與腎臟損傷/疾病的相關(guān)性分析、以及已知足細(xì)胞必需基因富集分析等,所有結(jié)果都支持這92個(gè)基因是足細(xì)胞特異的必需基因這一推測(cè)。
為了從功能上驗(yàn)證這些基因?qū)ψ慵?xì)胞的重要性,在體外培養(yǎng)的足細(xì)胞中利用siRNA敲低了部分基因,并檢測(cè)在足細(xì)胞結(jié)構(gòu)中起著關(guān)鍵作用的細(xì)胞骨架,結(jié)果發(fā)現(xiàn)37個(gè)基因敲低中有30個(gè)造成了足細(xì)胞骨架的損傷。
這些基因包括FGFR1、IFT80、AOX1、MYOM2、AIF1L、ANXA4、HAUS8、RAB3B、LPIN2、GOLIM4、CERS6、CYB5R4、ARHGEF18、ARPC1A、GPC1、MPP5、SRGAP1、ZNF277、ITGB5、ILDR2、NSF、TSC22D1、DNAJC11、ITGAV、SEPT10、MOCS2、FNBP1L、CRYAB、MTSS1以及TMOD3。
總之,通過(guò)對(duì)20個(gè)足細(xì)胞的單細(xì)胞測(cè)序分析,我們不僅發(fā)現(xiàn)大量新的足細(xì)胞特異的必需基因,并且發(fā)現(xiàn)它們主要參與足細(xì)胞骨架的形成和穩(wěn)定,與足細(xì)胞特有的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能相一致。
參考文獻(xiàn)
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