微生物在地球上已經(jīng)存在了至少38億年,幾乎遍及生物圈的各個(gè)角落,微生物代謝能力和代謝形式的多樣性是地球上的其他生物無(wú)法比擬的。微生物基因組較小,基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)得到的數(shù)據(jù)相比真核生物來(lái)說(shuō)相對(duì)較少,代謝組的研究則不會(huì)受此影響(已闡明的的微生物代謝物大概有20000種),可以全面理解微生物生理功能;這些因素使得代謝組學(xué)在微生物研究中具有自己獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。代謝組學(xué)作為功能基因組學(xué)研究技術(shù)家族的新成員,借助微生物細(xì)胞代謝物全組分分析用以反應(yīng)細(xì)胞對(duì)環(huán)境和基因變化的反應(yīng);由于代謝組學(xué)更接近于細(xì)胞功能的反映,所以代謝組學(xué)技術(shù)被認(rèn)為是研究微生物細(xì)胞功能良好的手段。此外,微生物體積微小、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、培養(yǎng)條件相對(duì)容易滿足、多數(shù)微生物可以在較短的時(shí)間內(nèi)獲得大量培養(yǎng)物、很容易將代謝過(guò)程與細(xì)胞功能或者表型相聯(lián)系;代謝組學(xué)得來(lái)的數(shù)據(jù)明顯不同于從基因組學(xué)(可能發(fā)生的)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)(可以發(fā)生的)和蛋白質(zhì)組學(xué)(賴以發(fā)生的)所得到的數(shù)據(jù),而是反映了細(xì)胞-已經(jīng)發(fā)生的情況; 百泰派克提供微生物代謝組學(xué)一站式服務(wù),您只需要將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮蛯?shí)驗(yàn)樣品寄給我們,我們將負(fù)責(zé)后續(xù)所有的實(shí)驗(yàn);百泰派克采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了分別針對(duì)于微生物初生代謝物和次生代謝物的代謝組學(xué)研究平臺(tái),根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取微生物代謝物進(jìn)行分析,在有效回答您生物學(xué)問(wèn)題的同時(shí)提高了代謝物鑒定和定量數(shù)量和準(zhǔn)確性。
為了從整體上分析代謝物,樣品提取方法應(yīng)該滿足下幾個(gè)要求: 盡可能多的提取代謝物;無(wú)偏向性;不破壞或改變代謝物的物理或化學(xué)特性。 在實(shí)際實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,我們會(huì)對(duì)您的實(shí)驗(yàn)樣品進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)。預(yù)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,我們會(huì)用多種不同的代謝分子萃取方式,并對(duì)每一種萃取方式得到的樣品進(jìn)行質(zhì)譜的分析;不同萃取方法得到的樣品進(jìn)行質(zhì)譜分析之后得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行深度的生物信息學(xué)分析,通過(guò)鑒定得到的代謝分子與您感興趣的代謝分子進(jìn)行匹配,基于此匹配的結(jié)果選擇合適的一到兩種萃取方法進(jìn)行后續(xù)正式批量樣品的處理和分析。
在技術(shù)報(bào)告中,百泰會(huì)為您提供詳細(xì)的中/英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括: 1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文) 2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文) 3. 質(zhì)譜圖片 4. 原始數(shù)據(jù) 5. 代謝組學(xué)分析結(jié)果
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