5’RACE試劑盒
產(chǎn)品及特點(diǎn)研究真核基因的最基礎(chǔ)的工作之一就是確定其轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn),目前最通用的方 法是 3′-RACE 法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是 Frohman 發(fā)明的、通過 PCR 快速克隆 cDNA 末端的技術(shù),它在不建立 cDNA 文庫(kù)的前提下, 利用已知 cDNA 序列設(shè)計(jì)引物,通過往兩端延伸和擴(kuò)增獲得其 3′-端序列。本試劑 盒就是根據(jù) 3′-RACE 原理而開發(fā),它具有下列特點(diǎn):
1. 即開即用,客戶不需要單獨(dú)準(zhǔn)備各種材料。
2. 反應(yīng)條件經(jīng)過精心優(yōu)化,包括使用無 RNase H 活性的 MMLV 和優(yōu)化的引物。
5’RACE試劑盒
規(guī)格及成分 成 分 編 號(hào) 十孔盒包裝
MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶-RI 混合液 101104a 20 μL(紅蓋)
MMLV Buffer-dNTP 混合液 101105b 60 μL(本色蓋)
微量核酸沉淀劑 50903 400 μL(綠蓋)
TdT(末端轉(zhuǎn)移酶) 120312 10 μL(白蓋)
2×TdT Buffer(含 dATP) 101105c 200 μL(黃蓋)
PCR MagicMix 3.0(含染料) 90805 1mL×2(紅蓋)
5′RACE 引物 A-引物 B 混合液 yw373374 200 μL(藍(lán)蓋)
5′RACE 引物 C yw375 200 μL(紫蓋)
RNase-Free 水 80403 1 mL(亮黃蓋)
使用手冊(cè) 101105sc 1 份
自備試劑
Poly(A) RNA(或總 RNA)、基因?qū)R恍砸?A、B、C、75%乙醇。注
自備試劑 Poly(A) RNA(或總 RNA)、基因?qū)R恍砸?A、基因?qū)R恍砸?B、超純水。
5’RACE試劑盒運(yùn)輸及保存 低溫運(yùn)輸、-20℃保存、有效期一年。
使用方法 一:引物的設(shè)計(jì)和準(zhǔn)備工作
利用已道序列的區(qū)域設(shè)計(jì)基因?qū)R恍砸锶龡l(A、B),其中引物 B 和 A 引物 比較,靠 3’端 10-30 個(gè)堿基,類似巢式 PCR 的引物設(shè)計(jì)。自備的基因?qū)R恍砸?的 Tm 跟 3′-RACE 引物 B 和引物 C 的一致,即 Tm 為 58℃。引物合成后加 超純水使其濃度為 10 μM,放冰上待用。
二:利用含 Oligo(dT)的 3’-RACE 引物 A 進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄
注意:MMLV 酶使用前必須短暫離心,因?yàn)樗?50%甘油,及其粘稠,否則將取不 到所需體積。
1. 在一個(gè) PCR 管中,加入以下組分:
成分 用量
Poly(A) RNA(或總RNA ) 0.2-2 μg(5 μg)
3′-RACE引物A(10 μM) 1 μL
MMLV Buffer (含dNTP溶液) 5 μL
RNase-Free水 補(bǔ)至19 μL
合計(jì) 19 μL
注意:如果可能,使用Poly(A) RNA作為模板。
2. 65℃保溫 5 分鐘, 展開 RNA 的二級(jí)結(jié)構(gòu),立即冰浴待用。
3. 在冰浴的 PCR 管中加入 1 μL MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶-RI 混合物。
4. 先 37℃保溫 60 分鐘,再 42℃保溫 30 分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),最后 50℃保溫 10 分鐘終止反應(yīng)。
5. 加入 0.5 mL RNase-free 水稀釋上步得到的 cDNA,冰浴待用。長(zhǎng)期放置需要 放-20℃保存。
三:利用基因?qū)R恍砸?A 和 3′ RACE 引物 B 進(jìn)行輪 PCR
6. 用不同量的 RT 反應(yīng)液(即稀釋后的 cDNA 模板)設(shè)置 PCR,樣品組需要設(shè)置 模板用量梯度,單位:μL。
7. 按下列參數(shù)進(jìn)行 cDNA 第二鏈的合成和 PCR:
第 1 步,cDNA 第二鏈的合成:52-60℃ 2 分,72℃ 40 分(此步的目地是合 成第二鏈的 cDNA,復(fù)性溫度需要根據(jù)自備基因?qū)R恍砸?A 的 Tm 值決定, 一般可以從 55℃開始)。
第二步 PCR 循環(huán):94℃ 1 分鐘,52-60℃ 1 分,72℃ 3 分(此步為 PCR 擴(kuò) 增,復(fù)性溫度需要根據(jù)自備基因?qū)R恍砸?A 的 Tm 值決定,一般可以從 55℃ 開始)。 最后延伸:72℃ 15 分
8. 取 5 μL PCR 反應(yīng)液進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳以確認(rèn) PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物。若得到目的擴(kuò) 增產(chǎn)物需要用于后續(xù)實(shí)驗(yàn),請(qǐng)于-20℃保存;若沒有得到目的擴(kuò)增產(chǎn)物,可按下 列步驟進(jìn)行巢式 PCR 反應(yīng)。
四:利用基因?qū)R恍砸?B 和 3′
9. 將上輪 PCR 產(chǎn)物(4 管)用水稀釋約 20 倍(在 50μL PCR 反應(yīng)液中加入 1mL 超純水),然后分別作為模板進(jìn)行巢式 PCR 擴(kuò)增。
10. PCR 反應(yīng)。按下列條件進(jìn)行 PCR: 第 1-30 次循環(huán):94℃ 1 分鐘,52-60℃ 1 分,72℃ 3 分(復(fù)性溫度需要根 據(jù)自備基因?qū)R恍砸?B 的 Tm 值進(jìn)行優(yōu)化,一般可以從 55℃開始)。最后延 伸:72℃ 15 分。
11. 電泳檢測(cè)。然后根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行 DNA 測(cè)序或 TA 克隆。
關(guān)鍵字: 5’RACE試劑盒廠家;5’RACE試劑盒現(xiàn)貨
上??道噬锟萍加邢薰臼且患壹邪l(fā)、生產(chǎn)、銷售、服務(wù)于一體的一家生物科技企業(yè),專營(yíng)生化試劑、標(biāo)準(zhǔn)品、基因、蛋白、抗體、Elisa試劑盒、細(xì)胞生物學(xué),分子生物學(xué)等高生物產(chǎn)品??偛课挥谏虾?,并在北京、廣東,江西,吉林等全國(guó)30多個(gè)省市設(shè)有分公司和代理機(jī)構(gòu)。涉及的產(chǎn)品被中國(guó)科學(xué)院、清華、北大、復(fù)旦,上海交大,復(fù)旦醫(yī)學(xué)院,上海中醫(yī)藥大學(xué),華東師范大學(xué),第二軍醫(yī)大學(xué),曙光醫(yī)院,浦東新區(qū)人民醫(yī)院等知名科研院所廣泛使用,可靠而穩(wěn)定的質(zhì)量和完善的售后服務(wù)確。