本試劑盒用于快速從福爾馬林固定、石蠟包埋組織樣品中提取RNA包括microRNA。獨特的裂解液/蛋白酶K迅速裂解細胞釋放出RNA,然后裂解混合物通過一個基因組DNA清除柱,基因組DNA被清除而RNA穿透濾過。濾過的RNA用乙醇調(diào)節(jié)結(jié)合條件后,RNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質(zhì)去除, 最后低鹽的RNase free H20將純凈RNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。得到的RNA可用于反轉(zhuǎn)錄PCR、熒光定量PCR等實驗。 產(chǎn)品組分: 裂解液——————15ml 結(jié)合液——————25 ml 漂洗液——————10ml 蛋白酶K——————20mg(可選) RNase-free H2O——————10ml 基因組DNA清除柱和收集管——————50套 RNA吸附柱和收集管室溫——————50套 產(chǎn)品特點: 1.完全不使用有毒的苯酚,氯仿等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟。 2.快速,簡捷,單個樣品RNA提取操作一般可在1小時內(nèi)完成。 3.試劑盒的獨特基因組清除柱和配方確保有效清除基因組DNA殘留,一般情況下得到的RNA不需要DNase消化,可直接用于反轉(zhuǎn)錄PCR、熒光定量PCR等實驗。 4.多次柱漂洗確保RNA高純度,可直接用于下游各種實驗。 注意事項: 1. 所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達到13000rpm的傳統(tǒng)臺式離心機,如Eppendorf 5415C 或者類似離心機。 2. 樣品處理量絕對不要超過基因組DNA清除柱和RNA吸附柱處理能力,否則造成DNA殘留或者產(chǎn)量降低。不同組織細胞種類RNA/DNA相差極大,例如胸腺脾臟DNA含量豐富,超過5mg就會超過柱子處理能力。COS細胞RNA含量豐富,超過3x106細胞就會超過柱子吸附能力。所以開始摸索實驗條件時,如果不清楚樣品DNA/RNA含量時寧可使用較少的樣品處理量,如不超過2個10μm厚度石蠟切片。將來根據(jù)樣品試驗情況增加或者減少處理量。 3. 裂解液PKD、結(jié)合液RBC中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。 4. 預防RNase 污染,應注意以下幾方面: 1) 經(jīng)常更換新手套。因為皮膚經(jīng)常帶有細菌,可能導致RNase 污染。 2) 使用無RNase 的塑料制品和槍頭避免交叉污染。 3) RNA提取過程中應使用不含RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小時,塑料器皿可在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鐘,然后用水徹底清洗,再滅菌,即可去除RNase。 4) 配制溶液應使用無RNase 的水。(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC 至終濃度0.1%( v/v),37℃放置過夜,高壓滅菌。) 5. 關(guān)于DNA 的微量殘留: 一般說來任何總RNA 提取試劑在提取過程中無法完全避免DNA 的微量殘留(DNase 消化也無法做到100%無殘留),本試劑盒采取了本公司獨特的緩沖體系和基因組DNA 清除柱技術(shù),絕大多數(shù)DNA 已經(jīng)被清除,可直接用于反轉(zhuǎn)錄PCR 和熒光定量PCR。個別特殊情況如DNA 含量過于豐富造成殘留或者要進行嚴格的mRNA 表達量分析熒光定量PCR,我們建議在進行模板和引物的選擇時: 1) 選用跨內(nèi)含子的引物,以穿過mRNA 中的連接區(qū),這樣DNA 就不能作為模板參與擴增反應。 2) 選擇基因組DNA 和cDNA 上擴增的產(chǎn)物大小不一樣的引物對。 6. RNA 純度及濃度檢測: 完整性: RNA 可用普通瓊脂糖凝膠電泳(電泳條件:膠濃度1.2%;0.5×TBE 電泳緩沖液;150v,15 分鐘)檢測完整性。由于石蠟包埋組織福爾馬林固定和包埋過程中一般由于RNA 與蛋白反應交聯(lián)會導致RNA 斷裂或者降解,一般電泳后UV下只能看到模糊彌散(smear)帶型,隨著儲存的時間越長,降解斷裂越嚴重,甚至只能看到峰值僅僅在100bp 左右的模糊條帶。這都屬于RNA 提取正常情況。 純度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白質(zhì)污染程度的參考指標。高質(zhì)量的RNA,OD260/OD280 讀數(shù)(10mMTris, pH7.5)在1.8-2.1 之間。OD260/OD280 讀數(shù)受測定所用溶液的pH 值影響。同一個RNA 樣品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數(shù)1.8-2.1 之間,在水溶液中所測讀數(shù)則可能在1.5-1.9之間,但這并不表示RNA不純。 濃度:取一定量的RNA 提取物,用RNase-free 水稀釋n 倍,用RNase-free 水將分光光度計調(diào)零,取稀釋液進行OD260, OD280 測定,按照以下公式進行RNA濃度的計算:終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數(shù)n)×40。 儲存條件:室溫,有效期9個月。 本制品別名:石蠟包埋組織microRNA提取試劑盒|石蠟包埋組織microRNA分離試劑盒|石蠟包埋組織microRNA純化試劑盒|石蠟包埋組織miRNA分離試劑盒|石蠟包埋組織miRNA純化試劑盒|石蠟包埋組織總RNA提取試劑盒|石蠟包埋組織總RNA純化試劑盒
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