催化劑：三氟甲基磺酸對氧化還原均極穩(wěn)定，可作為聚合、酯化、凝聚、脫水等反應的催化劑。它廣泛應用于塑料工業(yè)、燃料工業(yè)、制藥工業(yè)、除草劑和生長調節(jié)劑的合成，以及維生素的合成和糖工業(yè)等領域。

合成工具：作為已知的超強酸之一，三氟甲基磺酸被譽為萬能的合成工具。它可以用來制備多種化合物，如三氟甲磺酸酐和多種三氟甲磺酸衍生物。此外，它還是烯和醚類寡聚和多聚的有效催化劑。

醫(yī)藥領域：三氟甲基磺酸在醫(yī)藥行業(yè)中有著廣泛的應用。它可用于合成核苷、抗生素、類固醇、蛋白質、配糖類以及維生素等關鍵藥物成分。此外，它還被用于硅橡膠改性等領域。

化工行業(yè)：由于其強腐蝕性和吸濕性，三氟甲基磺酸在化工行業(yè)中也被廣泛使用。它可以替代傳統(tǒng)的硫酸、鹽酸等傳統(tǒng)無機酸，優(yōu)化和改進工藝過程。

異構化和烷基化催化劑：三氟甲基磺酸可用作異構化和烷基化的催化劑，用于制備特定結構的化合物，如2,3-二氫-2-茚酮和四氫萘酮等。

去除糖苷：在生物化學領域，三氟甲基磺酸可用于去除糖蛋白中的糖苷，為后續(xù)的蛋白質研究提供便利。

三氟甲磺酸酐（Tf2O）在電子化學領域可用于生產電子導電性聚合物。

三氟甲磺酸酐可用于合成除草劑。

三氟甲磺酸酐可用于塑料改性。