生物信息學( bioinformatics )是建立在數(shù)學、計算機科學和生命科學基礎之上的一門交叉科學。它包括生物信息的獲取、加工、存儲、分發(fā)、分析和解釋等各方面,綜合運用數(shù)學、計算機科學和生物學的各種工具,來闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學意義。
生物信息學的出現(xiàn)極大地推動了分子生物學、基因組學、蛋白質(zhì)組學和代謝組學等的發(fā)展,已經(jīng)成為醫(yī)學、農(nóng)學、生物學等學科發(fā)展的強大推動力,也是藥物設計、環(huán)境監(jiān)測等的重要技術(shù)支撐。生物信息學在基因的功能發(fā)現(xiàn)、疾病基因診斷、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測、基于結(jié)構(gòu)的藥物設計、藥物合成和制藥工業(yè)中起著極其重要的作用,生物信息學的應用大大加快了藥物的研究開發(fā)進程。
一、常規(guī)RNAseq,DNAseq分析,及后續(xù)個性化分析
1.1 GO分析:
1.2 KEGG分析
1.3 Reactome分析:
二、代謝組常規(guī)及個性化分析,代謝組轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
三、繪制遺傳圖譜:
四、文章、GEO數(shù)據(jù)挖掘分析。
五、常規(guī)及個性化統(tǒng)計作圖。
六、正常樣本和腫瘤樣本測序后聯(lián)合分析-體細胞變異和胚系變異均可:
七、TCR、BCR免疫分析:
八、基因家族分析:
九、單細胞、微生物多樣性、宏基因組等具體評估確定。
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