BER反應(yīng)緩沖液中包含40 mM HEPES–KOH (pH 7.8),5 mM MgCl2,0.5 mM DTT 和0.1 mM EDTA。一個 10 μl 體系的AP位點(diǎn)裂解反應(yīng)包含 BER 緩沖液混合物,純化的蛋白(3.3 nM APE1終濃度) 和 0.75 ng還原的AP位點(diǎn)雙鏈核苷酸?;旌弦涸?7攝氏度孵育1小時。加入1ul終止液(50% 丙三醇,10 mM 三羥甲基氨基甲烷鹽酸鹽, 1 mM EDTA,0.1%溴酚藍(lán) 以及 0.1%二甲苯藍(lán))?;旌弦涸?0到100攝氏度中變性2分鐘。然后樣品在15% TBE Criterion? Pre-Cast Gel上跑,電泳在30mA電流下進(jìn)行30分鐘,用磷光成像儀觀測放射性標(biāo)記的底物和反應(yīng)產(chǎn)物。潛在APE-1靶向化合物的抑制活性用0.1到100 μM濃度的藥物來測定。用ImageQuant軟件來分析來量化已分解的放射性條帶。IC50值是計(jì)算抑制50%APE1活性時的抑制劑濃度。