木瓜蛋白酶是一種含疏基(-SH)肽鏈內(nèi)切酶，具有蛋白酶和酯酶的活性，有較廣泛的特異性，對(duì)動(dòng)植物蛋白、多肽、酯、酰胺等有較強(qiáng)的水解能力，同時(shí)，還具有合成功能，能把蛋白水解物合成為類蛋白質(zhì)。溶于水和甘油，水溶液無色或淡黃色，有時(shí)呈乳白色；幾乎不溶于乙醇、氯仿和乙醚等有機(jī)溶劑。最適合PH值5.7(一般3～9.5皆可)，在中性或偏酸性時(shí)亦有作用，等電點(diǎn)18.75；最適合溫度55～60℃(一般10～85℃皆可)，耐熱性強(qiáng)，在90℃時(shí)也不會(huì)完全失活；受氧化劑抑制，還原性物質(zhì)激活。未經(jīng)澄清就干燥的酶即為粗制酶。

木瓜蛋白酶為白色至淺黃色無定形粉末，有一定吸濕性，或?yàn)橐后w。溶于水和甘油，水溶液無色至淡黃色，有時(shí)呈乳白色，幾乎不溶于乙醇，氯仿和乙醚等有機(jī)溶劑。

由木瓜的未成熟果實(shí)，經(jīng)提取乳液、凝固、沉降、干燥而成粗制品。一般工業(yè)上以粗制品的應(yīng)用為主。木瓜蛋白酶的生產(chǎn)方法有三種，分別是直接熱風(fēng)烘干法、噴霧干燥法及膜分離凍干法。
直接烘干
生產(chǎn)方法較簡單、快速，但生產(chǎn)出來的成品只是粗酶，雜質(zhì)多、色澤差且微生物超標(biāo)，酶活力也較低，只有60萬～80萬單位/g。多為個(gè)體工廠采用，已不能滿足國內(nèi)食品質(zhì)量衛(wèi)生安全等。
噴霧干燥
此法是先通過離心去除部分雜質(zhì)后再進(jìn)行噴霧干燥，所生產(chǎn)出的成品酶活力相對(duì)高，達(dá)到100萬單位/g左右，雜質(zhì)相對(duì)也較少，色澤相對(duì)也較白。但產(chǎn)品噴霧時(shí)容易粘壁，酶活損失較大，水溶性相對(duì)也較差，而且酶活穩(wěn)定性也較差。
膜分離法
該生產(chǎn)方法不但避免了以上兩種方法的缺點(diǎn)，且生產(chǎn)過程衛(wèi)生安全，收率也高，所生產(chǎn)的成品酶活損失小，酶活力一般可達(dá)到280萬～350萬單位/g，最高可達(dá)400萬單位/g，且酶活穩(wěn)定性好，純度高，色澤潔白，細(xì)菌數(shù)低，嚴(yán)格操作可達(dá)到醫(yī)藥級(jí)別。